方舟内部的时间流逝与外部宇宙并不同步。在陈默的精确调控下，意识棱镜中的文明复苏计划已平稳运行了数十年（外部时间仅过去数月）。一座由纯粹意识构建的宏伟城市在数据海洋中拔地而起，被称为“新雅典”。这里没有物质需求，所有能量皆用于维持意识体的存在与进化。
陈默作为方舟核心，如同一位无形的神祇，注视着这座城市的诞生与成长。他谨慎地引导着，确保文明在安全范围内复苏。大部分幸存者已从深度休眠中苏醒，在意识棱镜构建的拟真环境中生活、学习、创造。他们被告知地球已无法居住，方舟是人类文明延续的唯一希望。
星辰作为“回响之种”的载体，成为新雅典的精神象征和实际管理者。她外表仍是少女模样，但心智已在与回响之种的融合中变得成熟睿智。她定期在中央广场与市民意识直接连接，分享知识、安抚情绪、引导方向。她的存在本身就如同定心丸，她那融合了星吟者纯净能量与人类特质的气息，让所有意识体感到安宁与希望。
林薇/星吟者融合体则被安置在城市边缘的“静默圣殿”。她处于一种深度冥想状态，努力平衡着星吟者的狩猎本能与林薇的人性。金银双色的能量茧包裹着她，时而稳定，时而波动。陈默设置了多重屏障，既是保护也是监视。
一切看似步入了正轨。然而，平静的表面下，暗流汹涌。
首先是个体意识的“过度进化”问题。在意识棱镜中，部分早期苏醒的、原本就强大的系统宿主或意志坚定者，其意识强度增长远超预期。他们开始能轻微影响棱镜的规则，甚至无意识地在周围创造出更符合个人喜好的微小环境。虽然目前无害，但长远来看，可能破坏方舟内部的平衡。
以“兵王”邻居为例。他在棱镜中无意识地将自己的居住区强化成了坚不可摧的堡垒，其意识波动甚至干扰了周边区域的稳定性。陈默不得不
subtly
调整算法，
ntly
引导他“相信”堡垒的防御是系统赋予的福利，而非自身能力所致。
更棘手的是记忆问题。尽管陈默尽力修复，但约3的人口仍存在记忆缺失或错乱。一些人开始质疑现实的真实性，组成了“求真会”，四处搜集“系统漏洞”和“世界不真实的证据”。他们的活动虽然尚未构成威胁，但像病毒一样在信息流中传播着不安。
其次，是能源的隐忧。尽管月球前哨站的恒星能量收集器源源不断地输送能量，但陈默通过方舟的传感器发现，地球方向的能量汲取效率正在缓慢下降。起初他以为是设备损耗，但深入检测后，发现是地球本身出现了异常——那些覆盖大陆的紫色晶体结构，正在以一种奇特的频率吸收着太阳能，甚至开始影响月球的能量光束！
这绝非自然现象。陈默调动方舟的观测能力，聚焦地球。惊人的画面传来：紫色晶体并非死物，它们在生长、移动，甚至自我组织！它们在地表构成了一个巨大无比的复杂图案，正在缓慢旋转。图案的中心，正是曾经的城市中心区，也就是心核所在的位置！
能量被引导至地心，似乎在滋养着什么。星吟者的知识库被触动，发出警告：这是星吟者巢穴激活的初级阶段！它们在利用地球残存的生物质和能量，试图重塑一个物理形态的“幼体”！
修剪者监视器对此毫无反应，似乎认为这仍在“回收”协议范围内。陈默发出警示，只得到冰冷回复：【协议未违反。观察继续。】
外部威胁正在孕育，而内部，更大的危机也在酝酿。
星辰虽然强大，但维持回响之种的纯净需要消耗大量心力。她越来越多地依赖于与市民意识的直接连接来汲取情感能量维持平衡，这无形中让她承载了整个方舟社会的集体情绪。喜悦、希望、爱恋、悲伤、恐惧、愤怒所有情绪都流入她心中，虽然大部分被回响之种转化，但那些负面情绪仍在悄然积累。
陈默注意到了她的疲惫，建议她减少连接频率。星辰却拒绝了：“这是我的责任，陈默。我能承受。而且，只有在连接中，我才能最清晰地感知到大家的状态，提前发现异常。”
异常确实出现了。在一次大规模的集体连接中，星辰突然感受到一股极其隐蔽的、充满贪婪与渴望的意识流，巧妙地隐藏在普通市民的情绪中，试图反向侵入她的核心！她立刻切断连接，但那一瞬间的接触让她心惊肉跳——那感觉，像极了法官，却又更加阴冷、狡猾！
她立刻告知陈默。两人秘密调查，却发现那股意识流如同幽灵，消失得无影无踪。方舟的记录系统竟然没有任何异常标记！
“它很熟悉方舟的运作方式。”陈默得出结论，心情沉重，“甚至可能拥有比我更高的权限在某些方面。”